🩸 免裂红 · RBC 天然基质 · 靶向探针

Stereo-cell v2.0

血液涂片 → 转片 → 空间多组学测序,从 8 步到 5 步

1 核心洞察

💡 推翻"裂红→保留 WBC"的传统范式,利用红细胞本身作为天然保护基质。
正常血液:1 个 WBC 周围有 ~500 个 RBC
↓ 高密度涂片:RBC 填满所有细胞间隙
↓ RBC 无细胞核、无线粒体、无核糖体 → 无 mRNA
↓ RBC = 三重功能:
  ❶ 物理保护(转片时缓冲压力)
  ❷ 空间隔离(~400 μm 间隙,mRNA 不可能扩散跨过)
  ❸ 位置固定(WBC 嵌在 RBC 基质中,不会位移)
8 → 5
步骤缩减
80×
安全裕度(细胞间距 vs mRNA 扩散半径)
4 → 1
高风险步骤消除(裂红/洗涤/固定全跳过)

2 新旧方案对比

步骤v1.0(裂红方案)v2.0(免裂红)
1制备 poly-L-lysine 涂层玻片普通玻片即可
2全血涂片全血高密度涂片
3⚠️ 裂红(NH₄Cl/皂苷)跳过 ✕
4⚠️ 洗涤(细胞脱落风险)跳过 ✕
5⚠️ 固定(0.5% PFA)跳过 ✕
6成像成像
7转片转片(RBC 减震保护)
8全转录组测序靶向 PBMC 探针

3 为什么 RBC 不干扰测序?

🔬 成熟红细胞内容物
✕ 无细胞核 → 无基因组 DNA
✕ 无线粒体 → 无 mtDNA
✕ 无核糖体 → 无 rRNA
✕ 无 mRNA → 无转录本
仅含:血红蛋白(97% 干重)+ 微量 RNA 碎片
🎯 靶向 PBMC 探针
T 细胞:CD3D, CD4, CD8A
B 细胞:CD19, CD20, CD79A
单核细胞:CD14, CD16, CD68
NK 细胞:CD56, NKG7, GNLY
→ RBC 不表达这些基因,无信号

4 ~400 μm 间隙 = 天然单细胞隔离

500 nm
Stereo-seq spot 间距
~2-5 μm
单 WBC mRNA 扩散半径
~400 μm
两个 WBC 之间距离
安全裕度 = 400 μm ÷ 5 μm = 80 倍
即使最坏情况下的 mRNA 扩散,也绝无可能跨过 400 μm 的 RBC 矩阵到达相邻 WBC。
每个 WBC 是天然隔离的单细胞反应器。
10x 单细胞Stereo-cell v2
隔离单元油包水滴RBC 基质物理空间
交叉污染低(双细胞率 ~2-8%)绝对隔离(80× 裕度)
形态保留❌✅ 成像记录

5 RBC 转片保护效应

玻璃片 WBC (嵌在RBC基质中) → 转片 → Stereo-seq 芯片 WBC 完好 RBC = 天然减震 + 位置锁定 转片后形态不变 + 空间精确

RBC 矩阵在转片时弹性变形吸收压力,WBC 完好无损,空间位置精确保持。

6 风险评估(大幅降低)

剩余风险等级分析
血红蛋白干扰 RT🟡 中转片后芯片上 Triton X-100 洗涤即可消除
RBC 碎片物理阻挡 mRNA🟢 低透化前温和去脂处理
网织红细胞 RNA 污染🟢 低占 RBC <1%,信号远弱于 WBC
芯片利用率🟡 中靶向探针降低测序量,缓解成本
已消除的旧风险:
裂红细胞脱落 洗涤剪切力损伤 PFA 固定影响 mRNA 单细胞转片受压破裂 mRNA 交叉污染

7 与现有技术对比

维度10x scRNA-seqSMART-seqStereo-cell v2
细胞形态❌ 丢失❌ 丢失✅ 成像保留
空间坐标❌ 无❌ 无✅ xy
邻近关系❌ 无❌ 无✅ 保留
细胞分选需 FACS需手工✅ 不需要
样本量μL 级μL 级✅ 一滴指尖血
流程复杂度中高✅ 极低(5 步)

8 建议验证路线

1
高密度涂片 + 免裂红可行性(1 个月)
全血梯度涂片 → 亮场成像 → 转片到空白玻璃 → 算位移
2
Hb 干扰 + 洗涤优化(1-2 个月)
模拟 Hb + RT 体系测 RT 效率 → Triton X-100 芯片上洗涤
3
靶向探针捕获验证(2-3 个月)
FACS 分选 T/B/NK/Mono 混合 → PBMC 探针 + 测序 → 比对比例
4
真实血液验证(3-4 个月)
健康人指尖血 → Stereo-cell v2 → 比对血常规 + FACS